Gradina Botanica din Perugia, infiintata in anul 1768, a constat initial intr-un teren pe care au fost cultivate plante medicinale pentru a fi utilizate in tratamentul unor boli minore. Spre sfarsitul secolului al XVIII-lea, a fost mutata la Gradina de Barnabites, situata in zona utilizata in prezent ca o piata acoperita. In 1810 sediul Gradinii Botanice a fost din nou transferat pe terenul adiacent Palatului Olivetani. Odata cu infiintarea Institutului Agricol, acum Facultatea de Stiinte Agricole, sediul Gradinii a fost transferat inapoi in gradina manastirii benedictine de la Bazilica Sf. Petru. Gradina, are o suprafata de 6.000 de metri patrati.

Facultatea de Stiinte a simtit nevoia de a crea o noua gradina botanica, ca o prelungire a celei precedente. Apoi, intr-un lot de teren situat la Biserica San Costanzo, au inceput lucrarile de parcelare. Gradina acopera acum o suprafata de aproximativ 20.000 de metri patrati si detine un efect de sera de 700 de metri patrati si o constructie utilizata pentru birouri si sala de clasa pentru practica.